El componente político de la PiNN se encuentra en la Secretaría de Seguridad Alimentaria y Nutricional (SESAN) de la Presidencia de la República de Guatemala, que coordina las actividades de las organizaciones que forman parte del Consejo Nacional de Seguridad Alimentaria y Nutricional (CONASAN), integrado por ocho ministerios.
El componente de datos de la PiNN se ejecuta conjuntamente con la SESAN de la Presidencia de la República de Guatemala, que gestiona el sistema de información sobre seguridad alimentaria y nutrición (SIINSAN).
La asistencia técnica es proporcionada por el Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza (CATIE).
El proyecto es apoyado por la Delegación de la UE en Guatemala y gestionado por el CATIE.
